Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF4Q08170 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms