Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBQ06643 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms