Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms