Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms