Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIN1Q05586 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms