Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNEQ04844 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms