Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ID3Q02535 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms