Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC2Q02487 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms