Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OTUD4Q01804 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OTUD4Q01804 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms