Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC10Q01780 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC10Q01780 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms