Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA1DQ01668 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms