Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRSF2Q01130 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms