Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MDM2Q00987 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MDM2Q00987 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms