Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF9Q00978 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms