Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms