Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2C1P98194 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms