Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGD1P98174 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms