Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM193AP78312 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM193AP78312 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms