Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP25P60880 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms