Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF4A1P60842 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF4A1P60842 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms