Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3S2P59780 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3S2P59780 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms