Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms