Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFDNP55196 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFDNP55196 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFDNP55196 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFDNP55196 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms