Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAD23BP54727 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23BP54727 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23BP54727 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23BP54727 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23BP54727 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAD23BP54727 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms