Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNI2P48788 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms