Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NESP48681 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NESP48681 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NESP48681 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NESP48681 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NESP48681 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NESP48681 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NESP48681 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NESP48681 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms