Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS1P48651 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms