Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIA4P48058 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms