Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPZBP47756 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms