Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ACADSBP45954 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms