Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GDF5P43026 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GDF5P43026 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms