Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARL1P40616 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARL1P40616 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARL1P40616 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms