Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGAEP38570 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAEP38570 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms