Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GGCXP38435 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GGCXP38435 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GGCXP38435 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GGCXP38435 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GGCXP38435 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GGCXP38435 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GGCXP38435 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GGCXP38435 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms