Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNCAP37840 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNCAP37840 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms