Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC4P35249 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC4P35249 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC4P35249 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC4P35249 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC4P35249 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC4P35249 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC4P35249 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms