Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTPDP35247 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms