Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL9P32969 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL9P32969 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL9P32969 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms