Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA11P31270 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms