Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRDP23468 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms