Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HRCP23327 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HRCP23327 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HRCP23327 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HRCP23327 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HRCP23327 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HRCP23327 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms