Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA6P23229 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms