Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MDKP21741 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MDKP21741 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MDKP21741 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MDKP21741 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MDKP21741 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms