Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT1P21579 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT1P21579 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT1P21579 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT1P21579 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT1P21579 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT1P21579 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms