Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms