Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASTP20810 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASTP20810 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASTP20810 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASTP20810 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASTP20810 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASTP20810 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASTP20810 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASTP20810 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASTP20810 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASTP20810 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms