Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB9P17482 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms