Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IL7RP16871 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
IL7RP16871 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL7RP16871 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL7RP16871 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms