Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms