Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms